Excel saga met en scène plusieurs histoires parallèles ayant de nombreuses interactions complexes entre elles : cet article n'a donc nullement prétention à l'exhaustivité.
Hanako Dosukoi, plus connue sous le nom d'Excel est une jeune fille exubérante et pleine d'énergie. Elle vient d'obtenir son diplôme universitaire. Elle trouve alors du travail auprès d'une organisation secrète, Across, dont le but de l'unique membre (Il Palazzo, une parodie de dictateur) est d'asservir le monde. Excel, folle amoureuse de son maître travaille de manière acharnée mais inefficace pour l'aider à conquérir le monde (en commençant par F City, dont les égouts abritent la base d'Across). Elle cause au passage la mort accidentelle d'un travailleur venu de la Colombie, Pedro, dont les malheurs nous seront contés au fil des épisodes. Excel est bientôt rejointe dans sa mission par Hayatt, une princesse atteinte d'anémie venue de Mars et par Menchi, une petite chienne supposée servir de ration d'urgence. Avec Hayatt ont aussi débarqué les Puchu, extraterrestres aussi attendrissants que dangereux. Leur invasion de la Terre échoue mais de nombreux Puchus demeurent infiltrés dans la société (et les égouts) humains. Notons aussi la présence de Nabeshin, un homme mystérieux coiffé d'une coupe Afro qui intervient toujours au moment le moins attendu, sans raison apparente.
Personnages:
Excel
Jeune diplômée. Elle vit d'expédients et n'a qu'un seul but, servir Il Palazzo le leader d'Across, dont elle est amoureuse. Elle est morte dès le premier épisode, mais a été ressuscitée par la Volonté Suprême de l'Univers.
Hayatt
Princesse venue de Mars, en compagnie du Majordome de l'Espace (Space Butler), qui meurt durant le voyage. Personnage anémique et souffrant d'une maladie mystérieuse, Hayatt tombe souvent en état de "mortitude".
Il Palazzo
Leader d'Across. Il a passé le plus clair de son temps à s'ennuyer sur trône au fond de sa base secrète. D'un flegme à peu près absolu, il a néanmoins un caractère très infantile. À l'instar du Grand Pope, dans les Chevaliers du Zodiaque, il semble souffrir de troubles de la personnalité, son autre "moi" le poussant à conquérir le monde.
Menchi
Jeune chienne - qui ressemble à s'y méprendre à un chat - capturée par Excel. Elle doit servir de ration d'urgence en cas de besoin.
Pedro
Travailleur colombien involontairement tué par Excel. Il revient à la vie grâce à la Volonté Suprême de l'Univers. Hélas pour lui, la suite de sa vie est un long drame où il découvre entre autres les infidélités de sa femme et la trahison de son meilleur ami. (Personnage original de la version anime)
Nabeshin
Mystérieux aventurier à la coupe afro, aux interventions aussi inattendues que cocasses. Il s'agit en réalité du réalisateur du dessin animé (Nabeshin provient de SHINinchi wataNABE). On retrouve ce personnage dans Puni Puni Poemi, spin-off d'Excel Saga. (Personnage original de la version anime)
I'Z Chan
Volonté Suprême de l'Univers. C'est une sorte de mini-trou noir flottant à un mètre du sol, d'où sortent une paire de bras féminins. Elle a le pouvoir de faire revenir les gens à la vie, comme Excel et Pedro. Elle est mariée à Cet Homme, qu'elle ne supporte plus. (Personnage original de la version anime)
Watanabe
Voisin d'Excel. Il tombe amoureux d'Hayatt, dont il ignore tout. Toujours sans un sou.
Iwata
Ami de Watanabe. Homme à femmes, parasite et profiteur assez niais.
Sumiyoshi
Ami de Watanabe. Muet, mais d'une grande sagesse. Ses paroles ont l'accent du Kansai et flottent en l'air.
M. Kabapu
Responsable de la sécurité de la ville de F... . Il porte une fausse moustache rousse en plastique. Apparemment, il connait Il Palazzo et cherche à lutter contre Across..
Misaki Matsuya
Femme à poigne travaillant pour Kababu. Elle a la gâchette facile et ne supporte pas qu'on s'intéresse à elle de trop près. Iwata est amoureux d'elle.
Ropponmatsu I et II
Femmes-Cyborg créées par un savant fou, le docteur Shioji. Elles travaillent pour Kababu et leur puissance est totalement démesurée par rapport à leurs missions. Iwata est (également) amoureux de Ropponmatsu I. Ropponmatsu II a l'apparence d'une petite fille (le Dr Shioji souffre d'un "Lolita Complex" très prononcé) et considère toute femme plus âgée comme sa « grande s½ur ».
Cet Homme
Il ne porte pas d'autre nom. Il ressemble étrangement au chanteur Johnny Hallyday. Il est marié à la Volonté Suprême de l'Univers. C'est l'ennemi de Nabeshin et de Pedro, ce dernier s'étant attiré la haine de Cet Homme car il a couché avec la Volonté de l'Univers sans savoir qu'elle était l'épouse de Cet Homme. (Personnage original de la version anime)
Koshi Rikdo
Créateur d'"Excel Saga". Il apparaît à chaque début d'épisode pour valider les écarts des producteurs de la série par rapport à son manga original. Dans le premier épisode, Excel a pour mission de l'éliminer, mais elle n'arrive pas à le tuer car c'est son créateur.
Les Puchu
Extra-terrestres d'apparence mignonne et totalement inoffensive. Ce sont en réalité des créatures féroces et avides de conquêtes, révélant un visage hideux lorsqu'ils sont frappés.